合伙合同纠纷和合伙协议纠纷的区别是在内容上，合同的内容比较细致，还会涉及到违约的责任，但是协议是不会如此细致的内容，也不会有很清楚的违约责任划分。区分合伙合同纠纷和合伙协议纠纷首先要明确合同和协议的区别。协议是指有关国家、企业、事业单位、社会团体等或者个人，在平等协商的基础上订立的一种具有政治、经济或其他关系的契约。协议，在其所表示的意义、作用、格式、形式等方面基本上与合同是相同的。经济合同和以经济为内容的协议，都可以称为契约，两者都是确立当事人双方法律关系的法律文书。合同与协议虽然有其共同之处，但两者也有其明显区别。合同的特点是明确、详细、具体，并规定有违约责任。而协议的特点是没有具体标的、简单、概括、原则，不涉及违约责任。从其区别角度来说，协议是签订合同的基础，合同又是协议的具体化。