公司股东退出的清算方式是根据《中华人民共和国公司法》第七十一条进行的。股东可以通过协商转让股权的价格，并经过其他股东过半数同意后退出。如果其他股东未在三十天内答复，则视为同意转让。如果其他股东半数以上不同意转让，不同意的股东应购买该股权。在同等条件下，其他股东有优先购买权，购买比例可以协商确定或按出资比例行使。法律分析；公司股东退出的清算方式：一般由股权的转让人和受让人，协商转让的价格，达成一致后退出。当事人既可以按市场价格自行协商，也可以请评估机构评估，然后再申请办理股权的变更登记。公司股东退出怎么清算的法律依据。《中华人民共和国公司法》第七十一条。