专利与软件著作权关系在于都是属于知识产权的保护范畴，但是区别就在于权利和法律依据不同。软件著作权与专利权区别是权利内容和法律依据是有所不同的。著作权可以使在别人对软件盗版时，采取保护措施，防止别人盗版。然而对于竞争对手来讲，一样也是软件开发者，可以研究拥有的软件，理解思路，按照思路完全可以编出相同效果的软件，而且也不会侵犯著作权。这个时候，软件中最核心的东西，即软件的构思，著作权是无法保护到的。而软件专利则不同，其是以技术方案的形式申请的，就是软件流程图的内容。授权后，保护的是软件的构思，他人采用该构思，就可能构成侵权。因此软件专利的保护力度比软件著作权要大的多，能保护软件最核心的东西。另外，二者所采用的法律依据也不一样。