软件著作权证书丢失补办方法如下：1、可以登录“中国版权保护中心”网站，申请补发证书。2、申请补发证书之前需要先申请“计算机软件著作权证书查询”。3、取得查询结果后，再申请补发证书。4、查询、申请的材料可以同时提交至窗口（也可以邮寄，不过邮寄的材料受理的很慢）。版权中心现不收取任何官费。客户申请办理中华人民共和国国家版权局颁发的《计算机软件著作权登记证书》需要提交以下材料。1、按要求填写《计算机软件著作权登记申请表》证书需要提交以下材料。2、提供源程序前、后各连续40页。源程序不到60页的，应提交整个源程序。(电子文件、Word文档格式或纯文本格式可以接受)。