机动车登记证书补办流程如下：1、携带所需资料，开车到车辆注册地车管所办理，车辆通过查验通道，直接到查验点，开始查验车辆。2、工作人员对车辆进行查验，查验完成后，车主到查验服务处确认信息。3、然后到业务大厅导办服务台装订手续，排队等待办理，装订手续后，到对应窗口进行办理。4、携带受理凭证到收费窗口交费，然后到取证窗口打印机动车登记证书，补办完成。机动车登记证书灭失、丢失或者损毁的，机动车所有人应当向登记地车管所申请补领、换领，车管所将申请材料与驾驶证挡案进行核实，确认无误后就可以补发了。填写申请表并提交身份证明，补领机动车登记证书的，还应交验机动车，车辆管理所应当自受理之日起一日内，确认机动车，审查提交的证明、凭证，补发、换发机动车登记证书。法律依据：《机动车登记证》第三十四条。