（一）所得税缴纳不同。个人独资企业只需缴纳企业所得税；一人有限公司除公司缴纳企业所得税外，股东也需缴纳个人所得税。（二）建账要求不同。个体工商户需要建立收支凭证粘贴簿、进销货登记簿，完整保存有关纳税资料。个人独资企业和一人有限公司必须建立财务制度，进行会计核算。（三）支付方式不同。定期定额征收个人所得税，税务机关依照法律、行政法规的规定，个体工商户的某个位置，一定经营期间，应税收入的一定范围内的业务（包括业务编号）或收入的数量（以下简称“配额”）的验证，和计税依据，确定其应纳税额。个人独资企业投资者应缴纳的个人所得税，应当按年计算，分月或分季预缴。投资者应在每月或季度结束后7日内预付。结案时间为每年年底后3个月内。