深圳二套房公积金贷款额度计算方式如下：1、按住房公积金账户余额计算：贷款购买第2套住房的，贷款额度不高于公积金账户余额的10倍。2、按照房屋本身价格计算：购买家庭第二套改善性住房及其他符合购房条件的自有住房，贷款额度不超过房屋价格的70%。3、按贷款申请人的还贷能力计算：申请人本人贷款的，具体计算公式为借款人月工资总额+借款人所在单位住房公积金月缴存额乘40%-借款人现有贷款月应还款总额乘贷款期限（月）；如果是夫妻双方共同贷款，计算公式为（夫妻双方月工资总额+夫妻双方所在单位住房公积金月缴存额）乘40%-夫妻双方现有贷款月应还款总额乘贷款期限（月）。其中月工资总额=公积金月缴额除以（单位缴存比例+个人缴存比例）。