农村宅基地纠纷调解程序包括向政府提出申请，双方出示证据，工作人员调查取证，组织调解并制作调解书。如果调解不成功，土地管理部门将提出处理意见。根据《土地管理法》，宅基地纠纷可通过协商、行政或司法解决。同时，人民调解也是解决纠纷的一种方式，通过调解委员会促进当事人达成自愿协议。先进行调解，不能成功再进行起诉。法律分析；先进行调解，不能成功再进行起诉。农村宅基地纠纷调解程序。1、向县级以上人民政府土地管理部门或者乡级人民政府提出书面申请。2、双方当事人出示举证的材料和依据。3、工作人员现场调查材料和取证。4、组织双方当事人进行调解，制作书面调解书。5、调解未达成协议的，或者调节书送达前一方或者双方反悔的，土地管理部门及时提出处理意见，报人民政府错处处理决定。