股东出资纠纷案由是出资不足违约责任纠纷。一般股东间纠纷包括。1、股东权纠纷；该类诉讼包括股东知情权纠纷、公司盈余分配权纠纷、公司决议损害股东权纠纷、股东会议召集权纠纷等。2、出资纠纷；该类诉讼主要为出资不足违约纠纷。3、滥用股东权利纠纷。该类诉讼包括滥用股东权利损害公司利益纠纷、滥用股东权利损害债权人利益纠纷、发起人设立公司过失损害公司利益纠纷。4、董事、监事、经理损害公司利益纠纷。该类诉讼可以具体确定案由为董事、监事、经营损害公司利益纠纷。5、利用关联关系损害公司利益纠纷。一、如何解决股东出资纠纷。1、自行协商解决。2、由第三方调解（例如人民调解委员会）。3、向法院依法起诉。